أصيب أمام مسجد "أم القرى" بحي فيصل شمال محافظة السويس بجلطة دموية، تسببت بشلل بأطراف الجانب الأيمن من الجسم، واعوجاج بالفم، بعدما رفضت قوات الانقلاب تنفيذ حكم إخلاء السبيل الذي حصل عليه من محكمة جنح السويس.
وكان "رفاعي" قد صدر حكمًا بإخلاء سبيله على ذمة قضية مخالفة قانون التظاهر، إلا أن قوات الانقلاب احتجزته لعدة أيام بمقر الأمن الوطني، قبل أن تقوم بإضافة اسمه إلى قضية جديدة، وتصدر أمر ضبط وإحضار جديد، وتعيده لمحبسه بسجن عتاقة المركزي.
ولم يتحمل "رفاعي" الصدمة حيث سقط مغشيًا عليه، قبل أن تنقله قوات أمن الانقلاب لمستشفى السويس العام لتوقيع الكشف عليه، حيث تبين إصابته بجلطه دمويه، تم عمل الإسعافات الأولية ونقل المصاب إلى محبسه، بعد رفض قوات أمن الانقلاب بقائه لاستكمال العلاج.